答：员工出差取得的住宿费专用发票可以申报抵扣进行税额。
根据《关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》（财税［2016］36号）附件1营业税改征增值税试点实施办法规定：
第二十七条第（六）项规定了下列项目的进项税额不得从销项税额中抵扣：购进的旅客运输服务、贷款服务、餐饮服务、居民日常服务和娱乐服务。
会计分录如下：
开票方，
借：银行存款（或库存现金）
贷：主营业务收入（或其他业务收入）
贷：应交税费~应交增值税~销项税额
受票方，
借：管理费用（或产品销售费用）—差旅费
借;应交税费——应交增值税——进项税额
贷：库存现金（或银行存款）
关于员工出差的住宿费可以抵扣进项税额的解答及会计分录就为您介绍到这里，对此您是否还有什么疑问呢？如果您想系统的学习会计专业的知识，可以参考我们的网站——考呀呀会计网校。同时，我们将为您优质的课题，欢迎订购。
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